[资讯]生物医学的基因组工作平台

在过去生物医学的工作者们，各自开发自己的程序，这样导致他们使用的工具有很大的不同。如果能够有更加统一的方法，研究工作会进展的更好。

为了解决这个问题,服务器在哥伦比亚大学的计算生物学和生物信息学中心的基因组和细胞网络的多维分析国家中心（ National Center for Multiscale Analysis of Genomic and Cellular Networks (MAGnet)）开发了, geWorkbench (genomics Workbench), 应用程序的开发和扩展框架。它为很多有用的生物医学图形分析和可视化软件提供了统一的接口。

GeWorkbench是一个整合了基因表达和序列分析，以及细胞网络分析，并且具有强大的可视话功能的基因组分析平台。

现在在geWorkbench上已经有50多个分析应用程序。开发者每年增加5－10个并对已有的进行维护和升级。如果研究者需要的使用其没有的功能，它会提供到 caGrid 的接口。 CaGrid 是在caBIG下的网格设施，提供了很多可以在线和远程使用的网格工具。

如果研究者仍然不能找到他们所需要的工具，还可以使用geWorkbench平台来使用很少的语言开发他们自己的工具。


“GeWorkbench provides a user-friendly interface where researchers can collect the information and applications they need, search for and use a grid service when necessary, and quickly get results,” said Aris Floratos, of the Center for Computational Biology and Bioinformatics.



—Amelia Williamson, for iSGTW