生物 生物信息学

2009年1月9日星期五

分子图形软件——RasMol

RasMol 是一种分子图形软件,可用于蛋白质,核酸及一些小分子物质的可视化。可以跨平台运行于linux,unix,windows,apple,vsm等系统上。

RasMol 可以读取分子的坐标数据,然后交互式,多模式地显示出来。

(图片已删)
图示为DEOXY HEMOGLOBIN (A-GLYGLYGLY-C:V1M,L29W; B,D:V1M)

在生物化学中,或许我们对血红蛋白有个很抽象的了解,通过RasMol,我们可以从多个角度观看其各亚基的结构与位置。如图所示(数据来自pdb),可以看出血红蛋白四个亚基(1,2,3,4)的结构(a螺旋为主)及其内部的疏水区域(5)。并且可以通过改变视角和显示模型对血红蛋白有个更加直观的认识。

详情参见:www.rasmol.org

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